MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017807	CCG	2	6	1	6	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017807	CGC	2	6	41	46	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017807	CCG	2	6	135	140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017807	GCG	2	6	173	178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017807	CGT	2	6	197	202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017807	GA	3	6	237	242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017807	GAA	2	6	267	272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844948
8	NC_017807	GCAC	2	8	274	281	25 %	0 %	25 %	50 %	386844948
9	NC_017807	CCG	2	6	294	299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844948
10	NC_017807	G	6	6	321	326	0 %	0 %	100 %	0 %	386844948
11	NC_017807	ACG	2	6	335	340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844948
12	NC_017807	TTC	2	6	370	375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844948
13	NC_017807	GGC	2	6	544	549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844948
14	NC_017807	CTGACG	2	12	563	574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386844948
15	NC_017807	GCG	2	6	657	662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017807	CAT	2	6	710	715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017807	CCG	2	6	776	781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844949
18	NC_017807	CGT	2	6	815	820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
19	NC_017807	GAA	2	6	837	842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844949
20	NC_017807	GCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
21	NC_017807	AAG	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844949
22	NC_017807	TGC	2	6	985	990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
23	NC_017807	AAATC	2	10	1004	1013	60 %	20 %	0 %	20 %	386844949
24	NC_017807	ACG	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844949
25	NC_017807	GCA	3	9	1060	1068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844949
26	NC_017807	TGC	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
27	NC_017807	TTTG	2	8	1098	1105	0 %	75 %	25 %	0 %	386844949
28	NC_017807	GGC	2	6	1289	1294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844949
29	NC_017807	A	7	7	1323	1329	100 %	0 %	0 %	0 %	386844949
30	NC_017807	GCCGC	2	10	1358	1367	0 %	0 %	40 %	60 %	386844949
31	NC_017807	G	6	6	1430	1435	0 %	0 %	100 %	0 %	386844949
32	NC_017807	CAC	2	6	1466	1471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844949
33	NC_017807	GAT	2	6	1526	1531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844949
34	NC_017807	A	7	7	1545	1551	100 %	0 %	0 %	0 %	386844949
35	NC_017807	GCA	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844950
36	NC_017807	GCGA	2	8	1665	1672	25 %	0 %	50 %	25 %	386844950
37	NC_017807	GT	3	6	1695	1700	0 %	50 %	50 %	0 %	386844950
38	NC_017807	TGC	2	6	1747	1752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844950
39	NC_017807	T	6	6	1819	1824	0 %	100 %	0 %	0 %	386844950
40	NC_017807	GAT	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844950
41	NC_017807	AC	3	6	1876	1881	50 %	0 %	0 %	50 %	386844950
42	NC_017807	ATA	2	6	1966	1971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017807	AT	3	6	1978	1983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017807	TCCC	2	8	1987	1994	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017807	ATT	2	6	2038	2043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844951
46	NC_017807	ATT	2	6	2045	2050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844951
47	NC_017807	TTG	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844951
48	NC_017807	CTG	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844951
49	NC_017807	TG	3	6	2139	2144	0 %	50 %	50 %	0 %	386844951
50	NC_017807	CAG	2	6	2147	2152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844951
51	NC_017807	AT	4	8	2159	2166	50 %	50 %	0 %	0 %	386844951
52	NC_017807	TACAGG	2	12	2302	2313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386844951
53	NC_017807	TCT	2	6	2397	2402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844951
54	NC_017807	CCG	2	6	2548	2553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844951
55	NC_017807	ATT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844951
56	NC_017807	GCG	2	6	2616	2621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017807	TCA	2	6	2713	2718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017807	TAAA	2	8	2725	2732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017807	AC	3	6	2772	2777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017807	GTTTT	2	10	2812	2821	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017807	GT	3	6	2878	2883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017807	GT	3	6	2914	2919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017807	TG	3	6	2936	2941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017807	GT	3	6	2983	2988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017807	ATC	2	6	3014	3019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017807	TG	3	6	3024	3029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017807	AC	3	6	3043	3048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017807	AC	3	6	3076	3081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017807	CA	4	8	3108	3115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017807	AC	3	6	3142	3147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017807	CCAAA	2	10	3148	3157	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017807	AC	4	8	3189	3196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017807	AAT	2	6	3210	3215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017807	CCA	2	6	3218	3223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017807	AC	3	6	3316	3321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017807	ATTT	2	8	3348	3355	25 %	75 %	0 %	0 %	386844952
77	NC_017807	A	6	6	3361	3366	100 %	0 %	0 %	0 %	386844952
78	NC_017807	TCC	2	6	3438	3443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386844952
79	NC_017807	A	6	6	3480	3485	100 %	0 %	0 %	0 %	386844952
80	NC_017807	ATG	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844952
81	NC_017807	ATG	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844952
82	NC_017807	GGA	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386844952
83	NC_017807	GCC	2	6	3675	3680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844952
84	NC_017807	AGA	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844952
85	NC_017807	GCTG	2	8	3735	3742	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017807	CCGCCA	2	12	3810	3821	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386844953
87	NC_017807	CTG	2	6	3895	3900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844953
88	NC_017807	AAT	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844953
89	NC_017807	CG	3	6	3971	3976	0 %	0 %	50 %	50 %	386844953
90	NC_017807	T	6	6	3992	3997	0 %	100 %	0 %	0 %	386844953
91	NC_017807	CTG	2	6	4013	4018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844953
92	NC_017807	ATC	2	6	4057	4062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844953
93	NC_017807	CAC	2	6	4063	4068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844953
94	NC_017807	GCA	2	6	4095	4100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844953
95	NC_017807	TCA	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844953
96	NC_017807	TAA	2	6	4147	4152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844953
97	NC_017807	CTCC	2	8	4158	4165	0 %	25 %	0 %	75 %	386844953
98	NC_017807	TAA	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844953
99	NC_017807	T	6	6	4183	4188	0 %	100 %	0 %	0 %	386844953
100	NC_017807	CAC	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844953
101	NC_017807	GGC	2	6	4258	4263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844953
102	NC_017807	TCT	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844953
103	NC_017807	CTTTCA	2	12	4368	4379	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386844953
104	NC_017807	CTA	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017807	A	6	6	4464	4469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017807	T	13	13	4488	4500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017807	GGCG	2	8	4517	4524	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017807	ACGC	2	8	4537	4544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017807	TGA	2	6	4590	4595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844954
110	NC_017807	GGTAGC	2	12	4618	4629	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386844954
111	NC_017807	CGC	2	6	4738	4743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844954
112	NC_017807	GGT	2	6	4780	4785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844954
113	NC_017807	TTA	2	6	4920	4925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844954
114	NC_017807	TTA	2	6	4956	4961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844954
115	NC_017807	TTC	2	6	4985	4990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844954
116	NC_017807	ATTA	2	8	4997	5004	50 %	50 %	0 %	0 %	386844954
117	NC_017807	CAG	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844955
118	NC_017807	GAA	2	6	5089	5094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844955
119	NC_017807	TTC	2	6	5128	5133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844955
120	NC_017807	GCT	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844955
121	NC_017807	A	6	6	5197	5202	100 %	0 %	0 %	0 %	386844955
122	NC_017807	TGG	2	6	5215	5220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844955
123	NC_017807	CTT	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844955
124	NC_017807	GAAG	2	8	5355	5362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017807	GAAA	2	8	5382	5389	75 %	0 %	25 %	0 %	386844956
126	NC_017807	GCTGGC	2	12	5409	5420	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386844956
127	NC_017807	TGG	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844956
128	NC_017807	A	6	6	5501	5506	100 %	0 %	0 %	0 %	386844956
129	NC_017807	CAC	2	6	5511	5516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844956
130	NC_017807	CAA	2	6	5574	5579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844956
131	NC_017807	CGC	2	6	5646	5651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844956
132	NC_017807	A	6	6	5692	5697	100 %	0 %	0 %	0 %	386844956
133	NC_017807	AAG	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844956
134	NC_017807	CT	3	6	5809	5814	0 %	50 %	0 %	50 %	386844956
135	NC_017807	CAT	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844956
136	NC_017807	CTT	2	6	5984	5989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844957
137	NC_017807	TCG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844957
138	NC_017807	GCT	2	6	6196	6201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844957
139	NC_017807	CT	3	6	6265	6270	0 %	50 %	0 %	50 %	386844957
140	NC_017807	AGCC	2	8	6368	6375	25 %	0 %	25 %	50 %	386844957
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398	NC_017807	GGC	2	6	18190	18195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844972
399	NC_017807	GCG	3	9	18224	18232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844972
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401	NC_017807	CTG	2	6	18279	18284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844972
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